Cette communication est le résultat d'une réflexion conjointe menée entre chercheurs informaticiens et thématiciens confrontés à la gestion des données et métadonnées dans le cadre de projets propres à leur domaine. Après avoir précisé les spécificités du domaine visé ainsi que la base de travaux déjà existants, nous présentons un modèle général de structuration des métadonnées établi à partir d'une méthodologie objet. Ce modèle est ensuite validé au travers d'exemples extraits de projets menés par les auteurs. Finalement, nous suggérons d'intégrer les métadonnées comme une dimension à part entière dans nos systèmes d'information. En perspective, cette méthodologie peut être étendue aux systèmes d'information environnementaux à l'usage des gestionnaires et décideurs.