Motifs séquentiels discriminants pour les puces ADN

Résumé : Découvrir de nouvelles informations sur les groupes de gènes impliqués dans une maladie est un véritable challenge. Les puces ADN sont des outils puissants pour l'analyse des expressions de gènes. Elles mesurent l'expression de milliers de gènes dans différentes conditions biologiques. Dans cet article, nous proposons une nouvelle approche mettant en évidence des relations d'ordre entre les expressions de gènes. Notre contribution est double. Tout d'abord, nous extrayons des motifs séquentiels qui peuvent étre utilisés comme matériel d'étude par les biologistes. Or, comme la densité des bases issues des puces à ADN rend difficile l'extraction de ces motifs, nous introduisons une source de connaissances pendant le processus de fouille. De cette manière, l'espace de recherche est réduit et les résultats obtenus sont plus pertinents d'un point de vue biologique. Les expérimentations sur des données réelles soulignent la pertinence de notre proposition.
Type de document :
Communication dans un congrès
INFORSID'09 : Informatique des Organisations et Systèmes d'Information et de Décision, France. pp.397-412, 2009, 〈http://www.irit.fr/inforsid09/〉
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Contributeur : Paola Salle <>
Soumis le : lundi 15 juin 2009 - 08:55:44
Dernière modification le : jeudi 24 mai 2018 - 15:59:23

Identifiants

  • HAL Id : lirmm-00395119, version 1

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Citation

Paola Salle, Sandra Bringay, Maguelonne Teisseire. Motifs séquentiels discriminants pour les puces ADN. INFORSID'09 : Informatique des Organisations et Systèmes d'Information et de Décision, France. pp.397-412, 2009, 〈http://www.irit.fr/inforsid09/〉. 〈lirmm-00395119〉

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