Recherche de signatures pour la maladie d'Alzheimer : Extraction de motifs séquentiels discriminants à partir de puces ADN
Abstract
Dans le cadre du projet GeneMining mené en collaboration avec le laboratoire "Mécanismes moléculaires dans les démences neurodégénératives" (MMDN) de l'Université Montpellier 2, nous nous intéressons aux données issues de l'analyse de puces ADN. Ces biotechnologies reposent sur le principe suivant : dans un tissu cellulaire, selon les conditions biologiques, le niveau d'expression des gènes est différent. Les puces détectent les gènes transcrits et mesurent ces niveaux d'expression. Ces nouvelles technologies génèrent une masse de données difficilement analysable par les experts. Pour les aider dans cette tâche, il existe des techniques statistiques ou de classification qui mettent en évidence des groupes de gènes ayant un comportement similaire sous certaines conditions. Or, ces méthodes ne donnent aucune information sur les relations d'ordre existant entre les expressions des gènes ce qui pourrait constituer une signature caractéristique de la situation biologique.