Phylogeny Reconstruction Methods

Olivier Gascuel 1, *
* Auteur correspondant
1 MAB - Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique
LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
Abstract : Probabilistic models of character change/substitutions; Distance (minimum evolution, NJ, Fitch-Margoliash, etc.) and Parsimony methods; Likelihood and Bayesian methods; Tree search; Sources of error, both systematic and non-systematic, and approaches to address them: Stochastic variation, Model mis-specification (base composition; substitution matrices; others), Long-branch attraction, Taxon-sampling; others
Type de document :
Communication dans un congrès
CoME: Course on Computational Molecular Evolution, May 2010, Hiraklion, Greece. 2nd EMBO Practical Course on Computational Molecular Evolution, 2010, CoME II. 〈http://cwp.embo.org/pc10-25/〉
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00511822
Contributeur : Olivier Gascuel <>
Soumis le : jeudi 26 août 2010 - 12:14:23
Dernière modification le : jeudi 24 mai 2018 - 15:59:22

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  • HAL Id : lirmm-00511822, version 1

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Citation

Olivier Gascuel. Phylogeny Reconstruction Methods. CoME: Course on Computational Molecular Evolution, May 2010, Hiraklion, Greece. 2nd EMBO Practical Course on Computational Molecular Evolution, 2010, CoME II. 〈http://cwp.embo.org/pc10-25/〉. 〈lirmm-00511822〉

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