Ce travail se situe dans le contexte général de la construction et de la validation de l'expertise d'un domaine. Il vise la coopération de deux types de connaissances, hétérogènes par leur niveau de granularité et par leur formalisme : des dires d'experts représentés dans le modèle des graphes conceptuels et des données expérimentales représentées dans le modèle relationnel. Nous proposons d'automatiser deux étapes : d'une part, la génération d'une ontologie simple (partie terminologique du modèle des graphes conceptuels) guidée à la fois par le schéma relationnel et par les données qu'il contient ; d'autre part, l'évaluation de la validité des dires d'experts au sein des données expérimentales. La méthode que nous introduisons pour cela est fondée sur l'utilisation de graphes conceptuels patrons annotés. Ces résultats ont été implémentés au sein d'une application concrète concernant le contrôle de la qualité alimentaire.