SeaView Version 4: A Multiplatform Graphical User Interface for Sequence Alignment and Phylogenetic Tree Building

Manolo Gouy 1 Stéphane Guindon 2 Olivier Gascuel 2, *
* Auteur correspondant
2 MAB - Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique
LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
Abstract : We present SeaView version 4, a multiplatform program designed to facilitate multiple alignment and phylogenetic tree building from molecular sequence data through the use of a graphical user interface. SeaView version 4 combines all the functions of the widely used programs SeaView (in its previous versions) and Phylo_win, and expands them by adding network access to sequence databases, alignment with arbitrary algorithm, maximum-likelihood tree building with PhyML, and display, printing, and copy-to-clipboard of rooted or unrooted, binary or multifurcating phylogenetic trees. In relation to the wide present offer of tools and algorithms for phylogenetic analyses, SeaView is especially useful for teaching and for occasional users of such software. SeaView is freely available at http://pbil.univ-lyon1.fr/software/seaview.
Type de document :
Article dans une revue
Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2009, 27 (2), pp.221-224. 〈10.1093/molbev/msp259〉
Liste complète des métadonnées

Littérature citée [22 références]  Voir  Masquer  Télécharger

https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00511794
Contributeur : Olivier Gascuel <>
Soumis le : jeudi 26 août 2010 - 11:12:25
Dernière modification le : jeudi 28 juin 2018 - 14:37:47
Document(s) archivé(s) le : jeudi 1 décembre 2016 - 10:31:23

Fichier

GouyGuindonGascuel2010_manuscr...
Fichiers produits par l'(les) auteur(s)

Identifiants

Citation

Manolo Gouy, Stéphane Guindon, Olivier Gascuel. SeaView Version 4: A Multiplatform Graphical User Interface for Sequence Alignment and Phylogenetic Tree Building. Molecular Biology and Evolution, Oxford University Press (OUP), 2009, 27 (2), pp.221-224. 〈10.1093/molbev/msp259〉. 〈lirmm-00511794〉

Partager

Métriques

Consultations de la notice

231

Téléchargements de fichiers

1035