RNA-SequenLens for Visualizing RNA Secondary Structures

Florence Ying Wang 1 Arnaud Sallaberry 1 Mathieu Roche 2, 1
1 ADVANSE - ADVanced Analytics for data SciencE
LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
2 UMR TETIS - Territoires, Environnement, Télédétection et Information Spatiale
Abstract : In this paper, we present RNA-SequenLens to facilitate the visualization and comparison of RNA secondary structures. With RNA-SequenLens, all possible base pairings of a RNA sequence can be visualized at the desired probability threshold. Different RNA secondary structures can be easily compared. The interactive demo is available at https://youtu.be/C6EDC8LZJXw
Keywords : Visual Analytic
Type de document :
Communication dans un congrès
BioVis: Biological Data Visualization, Jul 2015, Dublin, Ireland. ISMB/ECCB, 5th Symposium on Biological Data Visualization, 2015
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https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-01184562
Contributeur : Mathieu Roche <>
Soumis le : dimanche 16 août 2015 - 06:02:54
Dernière modification le : mercredi 10 octobre 2018 - 14:28:11
Document(s) archivé(s) le : mardi 17 novembre 2015 - 10:11:35

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  • HAL Id : lirmm-01184562, version 1

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Citation

Florence Ying Wang, Arnaud Sallaberry, Mathieu Roche. RNA-SequenLens for Visualizing RNA Secondary Structures. BioVis: Biological Data Visualization, Jul 2015, Dublin, Ireland. ISMB/ECCB, 5th Symposium on Biological Data Visualization, 2015. 〈lirmm-01184562〉

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