AgBioData consortium recommendations for sustainable genomics and genetics databases for agriculture - LIRMM - Laboratoire d’Informatique, de Robotique et de Microélectronique de Montpellier Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Database -Weston- Année : 2018

AgBioData consortium recommendations for sustainable genomics and genetics databases for agriculture

Lisa Harper
  • Fonction : Auteur
Jacqueline Campbell
  • Fonction : Auteur
Ethalinda K S Cannon
  • Fonction : Auteur
Monica Poelchau
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 970999
Ramona Walls
  • Fonction : Auteur
Carson Andorf
  • Fonction : Auteur
Elizabeth Arnaud
Tanya Z Berardini
  • Fonction : Auteur
Clayton Birkett
  • Fonction : Auteur
Steve Cannon
  • Fonction : Auteur
James Carson
  • Fonction : Auteur
Bradford Condon
  • Fonction : Auteur
Nathan Dunn
  • Fonction : Auteur
Christine G Elsik
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 970989
Andrew Farmer
  • Fonction : Auteur
Stephen P Ficklin
  • Fonction : Auteur
Jodi Hu
  • Fonction : Auteur
Emily Grau
  • Fonction : Auteur
Nic Herndon
  • Fonction : Auteur
Jodi Humann
  • Fonction : Auteur
Gerard Lazo
  • Fonction : Auteur
Fiona Mccarthy
  • Fonction : Auteur
Naama Menda
  • Fonction : Auteur
Christopher J Mungall
  • Fonction : Auteur
Sushma Naithani
  • Fonction : Auteur
Rex Nelson
  • Fonction : Auteur
Daureen Nesdill
  • Fonction : Auteur
Carissa Park
  • Fonction : Auteur
Leonore Reiser
  • Fonction : Auteur
Lacey-Anne Sanderson
  • Fonction : Auteur
Taner Z Sen
  • Fonction : Auteur
Sabarinath Subramaniam
  • Fonction : Auteur
Marcela Karey Tello-Ruiz
  • Fonction : Auteur
Victor Unda
  • Fonction : Auteur
Deepak Unni
  • Fonction : Auteur
Liya Wang
  • Fonction : Auteur
  • PersonId : 922365
Jill Wegrzyn
  • Fonction : Auteur
Jason Williams
  • Fonction : Auteur
Margaret Woodhouse
  • Fonction : Auteur
Doreen Main
  • Fonction : Auteur

Résumé

The future of agricultural research depends on data. The sheer volume of agricultural biological data being produced today makes excellent data management essential. Governmental agencies, publishers and science funders require data management plans for publicly funded research. Furthermore, the value of data increases exponentially when they are properly stored, described, integrated and shared, so that they can be easily utilized in future analyses. AgBioData (https://www.agbiodata.org) is a consortium of people working at agricultural biological databases, data archives and knowledgbases who strive to identify common issues in database development, curation and management, with the goal of creating database products that are more Findable, Accessible, Interoperable and Reusable. We strive to promote authentic, detailed, accurate and explicit communication between all parties involved in scientific data. As a step toward this goal, we present the current state of biocuration, ontologies, metadata and persistence, database platforms, programmatic (machine) access to data, communication and sustainability with regard to data curation. Each section describes challenges and opportunities for these topics, along with recommendations and best practices.
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Dates et versions

lirmm-01964769 , version 1 (23-12-2018)

Licence

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Citer

Lisa Harper, Jacqueline Campbell, Ethalinda K S Cannon, Sook Jung, Monica Poelchau, et al.. AgBioData consortium recommendations for sustainable genomics and genetics databases for agriculture. Database -Weston-, 2018, 2018, pp.#bay088. ⟨10.1093/database/bay088⟩. ⟨lirmm-01964769⟩
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