Le trafic des images numériques augmente rapidement sur les réseaux. La protection des données numériques, et en particulier les images médicales, devient importante pour de nombreuses raisons telles que la confidentialité et l'intégrité. Actuellement, la façon la plus répandue de répondre au problème de la confidentialité est le cryptage. Cependant, les algorithmes classiques et modernes de chiffrement ne sont pas capables de chiffrer une énorme quantité de données dans un environnement en temps réel. Le cryptage sélectif (CS) est une approche qui ne chiffre qu'une partie des données afin de diminuer le temps de calcul tout en assurant une certaine sécurité. Cet article présente une nouvelle méthode de cryptage sélectif pour des images médicales comprimées au format JPEG. Cette méthode est basée sur le cryptage par flot avec AES d'une partie du flux binaire issue du codage par Huffman. Les résultats de la méthode proposée présentent un gain de temps de calcul significatif tout en conservant le taux de compression et le format initial de JPEG.