Maximum-likelihood-based inference of phylogenies

Olivier Gascuel 1, *
* Auteur correspondant
1 MAB - Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique
LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
Abstract : Maximum-likelihood (ML) methods are more and more used to infer phylogenies, because of their high level of accruracy. I'll present the main components and features of this approach: 1) preamble, basic principle and properties; 2) ML distance estimation; 3) tree likelihood computation via the pruning algorithm; 4) heuristics to search the tree space; 5) simulation results, computing times and topological accuracy compared to other methods; 6) approximate likelihood ratio test for branch supports.
Liste complète des métadonnées

https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00512555
Contributeur : Olivier Gascuel <>
Soumis le : lundi 30 août 2010 - 18:31:15
Dernière modification le : jeudi 24 mai 2018 - 15:59:22

Identifiants

  • HAL Id : lirmm-00512555, version 1

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Citation

Olivier Gascuel. Maximum-likelihood-based inference of phylogenies. Escuela Latinoamericana de Evolucion, Uruguay. 2009, 〈http://www.darwin200.edu.uy/elaevo/programa.html〉. 〈lirmm-00512555〉

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