Phylogenetic Models and Reconstructions

Olivier Gascuel 1, *
* Auteur correspondant
1 MAB - Méthodes et Algorithmes pour la Bioinformatique
LIRMM - Laboratoire d'Informatique de Robotique et de Microélectronique de Montpellier
Abstract : Presentation of the main approaches to build phylogenetic trees from sequence data. The focus will be on : (1) probabilistic models of sequence evolution (JC, K2P, HKY, GTR, JTT, WAG and LG) ; (2) modeling of rates accross sites using gama distributions ; (3) likelihood calculations; (4) tree inference approaches ; (5) bootstrap and other branch supports. I'll both explain the theory and train the students with practicals using standard programs and web servers (PHYLIP, PhyML, Phylogeny.fr).
Liste complète des métadonnées

https://hal-lirmm.ccsd.cnrs.fr/lirmm-00715604
Contributeur : Olivier Gascuel <>
Soumis le : dimanche 8 juillet 2012 - 19:21:48
Dernière modification le : jeudi 24 mai 2018 - 15:59:22

Identifiants

  • HAL Id : lirmm-00715604, version 1

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Citation

Olivier Gascuel. Phylogenetic Models and Reconstructions. IBSS'11: International Bioinformatics Software School, Tanger, Morocco. 2011, 〈http://www.smbi-maroc.org/IBSS2011/〉. 〈lirmm-00715604〉

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